Home
|
Linked Open Data
|
Browse
|
Search
|
Statistics
|
Download
RACE-PRO
PRO tracker
Community
PRO Consortium
Publications
Documentation
Protein Ontology report - ptx homeobox protein
PR:000000022 -
http://purl.obolibrary.org/obo/PR_000000022
Protein Forms
Annotations
Ontology Information
Show OBO stanza
/
PAF
PRO ID
PR:000000022
PRO name
ptx homeobox protein
Definition
"A protein that has a core domain composition consisting of an N-terminal K50 class Homeobox domain (
Pfam:PF00046
) and a C-terminal OAR domain (
Pfam:PF03826
). The homeobox domain consists of a self-folding, stable protein domain of 60 amino acids in which position 50 can confer a distinct DNA binding specificity. The K50 class of homeodomains recognizes a consensus DNA sequence of TAATCC. Homeodomain-containing proteins are known to play important roles in such diverse activities as embryonic pattern formation, cell-type specification, and differentiation." [
PMID:15895993
]
PRO Category
family
Parent
PR:000000001
protein
Terms by PRO Category
Organism-Independent
Organism-Specific
Category
Number of Terms
Category
Number of Terms
Family
1
Organism-Family
0
Gene
3
Organism-Gene
12
Sequence
5
Organism-Sequence
24
Modification
0
Organism-Modification
0
Term Hierarchy
Visualization
DAG:
OLS:
Back to top
Related Cross References
Db identifiers
PIRSF:PIRSF000563
Back to top
Protein Forms
Switch to
Extended View
Category
PRO Form Name
Short Name
Ann.
Has Annotation?
Comp.
In Complex?
family
PR:000000022
ptx homeobox protein
NOG
Yes
gene
PR:000000117
pituitary homeobox 2
PITX2
organism-gene
PR:O93385
pituitary homeobox 2 (chicken)
chick-PITX2
organism-sequence
PR:O93385-1
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C (chicken)
chick-PITX2/iso:Ptx2C
organism-sequence
PR:O93385-2
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A (chicken)
chick-PITX2/iso:Ptx2A
organism-gene
PR:P97474
pituitary homeobox 2 (mouse)
mPITX2
organism-sequence
PR:000036295
pituitary homeobox 2 isoform 4 (mouse)
mPITX2/iso:4
organism-sequence
PR:P97474-1
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2B (mouse)
mPITX2/iso:Ptx2B
Yes
organism-sequence
PR:P97474-2
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C (mouse)
mPITX2/iso:Ptx2C
Yes
organism-sequence
PR:P97474-3
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A (mouse)
mPITX2/iso:Ptx2A
Yes
organism-sequence
PR:P97474-4
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2Calpha (mouse)
mPITX2/iso:Ptx2Calpha
organism-sequence
PR:P97474-5
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2Cbeta (mouse)
mPITX2/iso:Ptx2Cbeta
organism-gene
PR:Q99697
pituitary homeobox 2 (human)
hPITX2
organism-sequence
PR:000000298
pituitary homeobox 2 sequence variant R89W (human)
hPITX2/var:R89W
Yes
organism-sequence
PR:000000299
pituitary homeobox 2 sequence variant L100Q (human)
hPITX2/var:L100Q
Yes
organism-sequence
PR:000000300
pituitary homeobox 2 sequence variant T114P (human)
hPITX2/var:T114P
Yes
organism-sequence
PR:000000301
pituitary homeobox 2 sequence variant R115H (human)
hPITX2/var:R115H
Yes
organism-sequence
PR:000000302
pituitary homeobox 2 sequence variant R137P (human)
hPITX2/var:R137P
Yes
organism-sequence
PR:000036294
pituitary homeobox 2 isoform 4 (human)
hPITX2/iso:4
Yes
organism-sequence
PR:Q99697-1
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2B (human)
hPITX2/iso:Ptx2B
Yes
organism-sequence
PR:Q99697-2
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C (human)
hPITX2/iso:Ptx2C
Yes
organism-sequence
PR:Q99697-3
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A (human)
hPITX2/iso:Ptx2A
Yes
organism-gene
PR:Q9R0W1
pituitary homeobox 2 (rat)
rPITX2
organism-sequence
PR:Q9R0W1-1
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C (rat)
rPITX2/iso:Ptx2C
organism-sequence
PR:Q9R0W1-2
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A (rat)
rPITX2/iso:Ptx2A
organism-gene
PR:Q9W5Z2
pituitary homeobox 2 (zebrafish)
z-PITX2
organism-sequence
PR:Q9W5Z2-1
pituitary homeobox 2 isoform c (zebrafish)
z-PITX2/iso:c
organism-sequence
PR:Q9W5Z2-2
pituitary homeobox 2 isoform a (zebrafish)
z-PITX2/iso:a
sequence
PR:000000294
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A
PITX2/iso:Ptx2A
organism-sequence
PR:O93385-2
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A (chicken)
chick-PITX2/iso:Ptx2A
organism-sequence
PR:P97474-3
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A (mouse)
mPITX2/iso:Ptx2A
Yes
organism-sequence
PR:Q99697-3
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A (human)
hPITX2/iso:Ptx2A
Yes
organism-sequence
PR:Q9R0W1-2
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2A (rat)
rPITX2/iso:Ptx2A
sequence
PR:000000295
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2B
PITX2/iso:Ptx2B
organism-sequence
PR:P97474-1
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2B (mouse)
mPITX2/iso:Ptx2B
Yes
organism-sequence
PR:Q99697-1
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2B (human)
hPITX2/iso:Ptx2B
Yes
sequence
PR:000000296
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C
PITX2/iso:Ptx2C
organism-sequence
PR:O93385-1
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C (chicken)
chick-PITX2/iso:Ptx2C
organism-sequence
PR:P97474-2
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C (mouse)
mPITX2/iso:Ptx2C
Yes
organism-sequence
PR:Q99697-2
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C (human)
hPITX2/iso:Ptx2C
Yes
organism-sequence
PR:Q9R0W1-1
pituitary homeobox 2 isoform Ptx2C (rat)
rPITX2/iso:Ptx2C
sequence
PR:000000297
pituitary homeobox 2 isoform 4
PITX2/iso:4
organism-sequence
PR:000036294
pituitary homeobox 2 isoform 4 (human)
hPITX2/iso:4
Yes
organism-sequence
PR:000036295
pituitary homeobox 2 isoform 4 (mouse)
mPITX2/iso:4
gene
PR:000012760
pituitary homeobox 1
PITX1
organism-gene
PR:P70314
pituitary homeobox 1 (mouse)
mPITX1
organism-gene
PR:P78337
pituitary homeobox 1 (human)
hPITX1
organism-gene
PR:Q99NA7
pituitary homeobox 1 (rat)
rPITX1
gene
PR:000012761
pituitary homeobox 3
PITX3
organism-gene
PR:O35160
pituitary homeobox 3 (mouse)
mPITX3
organism-sequence
PR:O35160-1
pituitary homeobox 3 isoform 1 (mouse)
mPITX3/iso:1
organism-gene
PR:O75364
pituitary homeobox 3 (human)
hPITX3
organism-sequence
PR:O75364-1
pituitary homeobox 3 isoform 1 (human)
hPITX3/iso:1
organism-gene
PR:P81062
pituitary homeobox 3 (rat)
rPITX3
organism-sequence
PR:P81062-1
pituitary homeobox 3 isoform 1 (rat)
rPITX3/iso:1
organism-gene
PR:Q24256
homeobox protein B-H2 (fruit fly)
fly-PITX3
sequence
PR:000038343
pituitary homeobox 3 isoform 1
PITX3/iso:1
organism-sequence
PR:O35160-1
pituitary homeobox 3 isoform 1 (mouse)
mPITX3/iso:1
organism-sequence
PR:O75364-1
pituitary homeobox 3 isoform 1 (human)
hPITX3/iso:1
organism-sequence
PR:P81062-1
pituitary homeobox 3 isoform 1 (rat)
rPITX3/iso:1
Back to top
Functional Annotation (GO-centric view)
Switch to
PRO Centric View
Biological Process GO Term
Protein Forms & Complexes
Evidence
GO:0006355
regulation of DNA-templated transcription
PR:000000022
NOG
PIRSF:PIRSF000563
GO:0007179
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
PR:P97474-2
mPITX2/iso:Ptx2C
PMID:10585561
GO:0007266
Rho protein signal transduction
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
GO:0007275
multicellular organism development
PR:000000022
NOG
PIRSF:PIRSF000563
GO:0007368
determination of left/right symmetry
PR:P97474-1
mPITX2/iso:Ptx2B
PMID:12397115
PR:P97474-2
mPITX2/iso:Ptx2C
PMID:9708732
PR:Q99697-1
hPITX2/iso:Ptx2B
PMID:9708732
NOT
GO:0007368
determination of left/right symmetry
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:10585561
GO:0007507
heart development
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
GO:0007520
myoblast fusion
PR:P97474-2
mPITX2/iso:Ptx2C
MGI_ref:3686567;
PMID:16958127
GO:0009887
animal organ morphogenesis
PR:P97474-2
mPITX2/iso:Ptx2C
PMID:10585561
PR:Q99697-1
hPITX2/iso:Ptx2B
PMID:9618168
GO:0016055
Wnt signaling pathway
PR:P97474-1
mPITX2/iso:Ptx2B
PMID:12464179
GO:0030036
actin cytoskeleton organization
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
GO:0043388
positive regulation of DNA binding
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
MGI_ref:3796777;
PMID:18458156
GO:0043433
negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
PR:000036294
hPITX2/iso:4
PMID:11948188
GO:2000288
positive regulation of myoblast proliferation
PR:P97474-2
mPITX2/iso:Ptx2C
MGI_ref:3686567;
PMID:16958127
Disease Associated GO Term
Protein Forms & Complexes
Evidence
DO:0050786
iridogoniodysgenesis syndrome
PR:000000298
hPITX2/var:R89W
PMID:9437321
PR:000000301
hPITX2/var:R115H
PMID:9618168
DO:14686
Axenfeld-Rieger syndrome
PR:000000299
hPITX2/var:L100Q
PMID:8944018
PR:000000300
hPITX2/var:T114P
PMID:8944018
PR:000000302
hPITX2/var:R137P
PMID:8944018
Molecular Function GO Term
Protein Forms & Complexes
Evidence
GO:0000981
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
MGI_ref:3796777;
PMID:18458156
GO:0003677
DNA binding
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
MGI_ref:3796777;
PMID:18458156
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
NOT
GO:0003677
DNA binding
PR:000036294
hPITX2/iso:4
PMID:11948188
GO:0003700
DNA-binding transcription factor activity
PR:000000022
NOG
PIRSF:PIRSF000563
GO:0003712
transcription coregulator activity
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
MGI_ref:3796777;
PMID:18458156
GO:0005515
protein binding
PR:000036294
hPITX2/iso:4
PMID:11948188
PR:000036294
hPITX2/iso:4
PMID:11948188
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
MGI_ref:3796777;
PMID:18458156
PR:Q99697-1
hPITX2/iso:Ptx2B
PMID:11948188
PR:Q99697-1
hPITX2/iso:Ptx2B
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-2
hPITX2/iso:Ptx2C
PMID:11948188
PR:Q99697-3
hPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11948188
GO:0008134
transcription factor binding
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:15385555
PR:Q99697-3
hPITX2/iso:Ptx2A
PMID:16449236
Cellular Location GO Term
Protein Forms & Complexes
Evidence
GO:0005634
nucleus
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:P97474-3
mPITX2/iso:Ptx2A
PMID:11854422
PR:Q99697-3
hPITX2/iso:Ptx2A
PMID:16449236
GO:0005667
transcription factor complex
PR:P97474-1
mPITX2/iso:Ptx2B
PMID:12464179
;
PMID:15385555